أويا يعود تاريخها إلى الفينيقيين الذين أسموها أويا وقد قاموا بتأسيسها بمساعدة الإيليميين بعد ان فروا من صقلية بعد الإضطرابات الأهلية هناك. و قد عرفت المدينة باسم أويات بيلات ماكار (أويات بلدة الإله ملقارت) و قد أكتشف بمدينة طرابلس ( أويا ) العديد من القبور الفينيقية و البونيقية ،كما أكتشف بها مصنع فينيقي لإنتاج الفخار.وفي العصر الروماني أقام الرومان منشأت رومانية لم يتبقى منها سوى قوس النصر في البلدة القديمة والمعروف بقوس ماركوس أوريليوس نسبة لذلك الإمبراطور الروماني و في ذلك العهد أيضا منحت المدينة درجة المستعمرة زمن تراجان أواخر القرن الأول م حتى عهد الإمبراطور انطونيوس بيوس في القرن الثاني م.

و يعتقد أيضاً أن اجراء المزيد من الحفريات في طرابلس (ويات) سيكشف عن عمق جذور الحضارة الفينيقية الكنعانية في التاريخ الليبي. «فهذه المدينة كانت دائما مبنية ومأهولة وبالتالي لم تتح الفرص لاجراء حفريات فيها على غرار الحفريات التي اجريت في صبراتا ولبدة. ورغم هذا فإن الحضارة الفينيقية جلية في المدن الكبرى الثلاث: لبدة الكبرى وويات وصبراتة. وهذه المعالم ما زالت موجودة وظاهرة ثم انتقلت إلى أعماق ليبيا. ويرى الباحثون أن اتجاهات أبواب قوس الإمبراطور الروماني ماركوس اوريليوس تمثل اتجاهات المدينة الفينيقية القديمة التي اقيمت عليها مدينة رومانية».

و خضعت المدينة لحكم الوندال ( القرن5 م ) و للحكم البيزنطي (القرن 6م ) و خلال غزوات الوندال ُدمرت أسوار لبدة و صبراتة و كان نتيجة ذلك نمو أويا وأزدادت أهميتها بعد أن كانت الأقل أهمية في مدن طرابلس.

و في عام 645م فتحها العرب المسلمون وبقيت المدينة تحت الحكم العربي بعد ذلك (ما عدا من 1146-1158م عندما أستولى عليها النورمان الصقلًيون) .
كما أن الإسبان قصفوها في 1510م و غزاها الأتراك عام 1551م و بعدها أصبحت طرابلس ( أويا ) العاصمة الإستعمارية للإمبراطورية العثمانية التركية. ومرت عليها الكثير من الأحداث و المعارك ثم اصبحت تحت الإحتلال الإيطالي وكذلك كانت عاصمة للجمهورية الطرابلسية وفيما بعد أصبحت عاصمة ليبيا , وتعود تسمية المدينة الى انها واحدة من مدن ثلاث بناها الفينيقيون وهي أويات “طرابلس الحالية” و لبدة و صبراته. تضم المدينة حوالى 36 مسجد و3 حمامات تاريخية ومدرستان ومستشفى يعرف بمستشفى الغربة القديم بشارع سيدى سالم المشاط كما تضم المدينة كنيسة وسجن للنصارى وعدد من المبانى التاريخية منها حوش القرمانلى وعدد من القنصليات التاريخية منها القنصلية الانجليزيه و الهولندية و الفرنسية وقنصلية جنوا والعديد من الاسواق القديمة.